配列名:ASM465v1
ゲノム配列名 | ASM465v1 | 系統名 | subsp. indica, cv. 93-11 |
配列数 | 10,490 | 染色体数 | 2n = 2x = 24 |
配列長 (bp) | 427,004,890 | N50長 (bp) | 31,240,961 |
遺伝子の数 | 40,745 | 遺伝子数由来ファイル | Oryza_indica.ASM465v1.pep.all.fa |
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 | 40,745 | Hayai-Annotation バージョン | zen_v2.0 |
シーケンシングの方法 | WGS, BAC | 取得した配列量 | NA |
アセンブリ方法 | NA | 推定ゲノムサイズ (Mb) | 489 |
シーケンシングの方法のコメント | NA | コメント | NA |
論文クレジット情報 | 準備中 | データ/DB クレジット情報 | 準備中 |
責任著者 | Jun Yu (Beijing Genomics Institute), Huanming Yang (ditto), Jian Wang (ditto), Gane Ka-Shu Wong (ditto) | データソース名 | Ensembl |
論文 (DOIコード) | 10.1371/journal.pbio.0030038 | データソースURL | http://plants.ensembl.org/index.html |
BUSCO バージョン | 5.1.0 | BUSCO データセット | embryophyta_odb10 |
BUSCO ゲノム | C:96.3%[S:93.9%,D:2.4%],F:2.2%,M:1.5%,n:1614 | BUSCO 遺伝子 (pep/cds) | C:92.4%[S:90.2%,D:2.2%],F:4.5%,M:3.1%,n:1614 |