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アセンブル , シーケンス , Assemble , Sequence , Oryza sativa subsp. indica , Japonica rice , イネ インディカ亜種

Oryza sativa

Genome Assembly ID:t4530.G001

配列名:ASM465v1

ゲノム配列の詳細

ゲノム配列名 ASM465v1 系統名 subsp. indica, cv. 93-11
配列数 10,490 染色体数 2n = 2x = 24
配列長 (bp) 427,004,890 N50長 (bp) 31,240,961
遺伝子の数 40,745 遺伝子数由来ファイル Oryza_indica.ASM465v1.pep.all.fa
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 40,745 Hayai-Annotation バージョン zen_v2.0
シーケンシングの方法 WGS, BAC 取得した配列量 NA
アセンブリ方法 NA 推定ゲノムサイズ (Mb) 489
シーケンシングの方法のコメント NA コメント NA
論文クレジット情報 準備中 データ/DB クレジット情報 準備中
責任著者 Jun Yu (Beijing Genomics Institute), Huanming Yang (ditto), Jian Wang (ditto), Gane Ka-Shu Wong (ditto) データソース名 Ensembl
論文 (DOIコード) 10.1371/journal.pbio.0030038 データソースURL http://plants.ensembl.org/index.html
BUSCO バージョン 5.1.0 BUSCO データセット embryophyta_odb10
BUSCO ゲノム C:96.3%[S:93.9%,D:2.4%],F:2.2%,M:1.5%,n:1614 BUSCO 遺伝子 (pep/cds) C:92.4%[S:90.2%,D:2.2%],F:4.5%,M:3.1%,n:1614

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染色体 /
Scaffolds
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終了位置
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fasta
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