配列名:GCA_905175345.1
ゲノム配列名 | GCA_905175345.1 | 系統名 | ASS3 |
配列数 | 13 | 染色体数 | 2n = 4x = 26 |
配列長 (bp) | 262,563,758 | N50長 (bp) | 19,590,761 |
遺伝子の数 | 0 | 遺伝子数由来ファイル | NA |
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 | 0 | Hayai-Annotation バージョン | zen_v2.0 |
シーケンシングの方法 | PacBio, Hi-C | 取得した配列量 | 50x(PacBio) |
アセンブリ方法 | FALCON (v.0.3.0), Canu (v.1.3.0) | 推定ゲノムサイズ (Mb) | 305 |
シーケンシングの方法のコメント | NA | コメント | A. arenosa is a model plant species used to study the natural phenomenon of autopolyploidyzation, which means the duplication of the whole genome within one species. Synonym: Arabis suecica |
論文クレジット情報 | 準備中 | データ/DB クレジット情報 | 準備中 |
責任著者 | Magnus Nordborg (Vienna BioCenter) | データソース名 | ENA |
論文 (DOIコード) | 10.1038/s41559-021-01525-w | データソースURL | https://www.ebi.ac.uk/ena/browser/home |
BUSCO バージョン | BUSCO データセット | ||
BUSCO ゲノム | BUSCO 遺伝子 (pep/cds) |