Plant GARDEN 使い方 ▶︎

JA

EN

アセンブル , シーケンス , Assemble , Sequence , Arabidopsis suecica , Swedish cress , Arabidopsis suecica

Arabidopsis suecica

Genome Assembly ID:t45249.G001

配列名:ASM1920280v1

ゲノム配列の詳細

ゲノム配列名 ASM1920280v1 系統名 NA
配列数 269 染色体数 2n = 4x = 26
配列長 (bp) 272,254,484 N50長 (bp) 19,834,363
遺伝子の数 63,469 遺伝子数由来ファイル GCA_019202805.1_ASM1920280v1_protein.faa.gz
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 0 Hayai-Annotation バージョン zen_v2.0
シーケンシングの方法 PacBio Sequel 取得した配列量 268x
アセンブリ方法 3D DNA pipeline v.180114 推定ゲノムサイズ (Mb) 312
シーケンシングの方法のコメント NA コメント Synonym: Arabis suecica
論文クレジット情報 準備中 データ/DB クレジット情報 準備中
責任著者 Z. Jeffrey Chen (The University of Texas at Austin) データソース名 NCBI
論文 (DOIコード) 10.1038/s41559-021-01523-y データソースURL https://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/genomes/all/GCA/019/202/805/GCA_019202805.1_ASM1920280v1/
BUSCO バージョン BUSCO データセット
BUSCO ゲノム BUSCO 遺伝子 (pep/cds)

遺伝子をさがす

遺伝子データは登録されていません。

ゲノム配列を切り出す

染色体 /
Scaffolds
開始位置
終了位置
相補鎖を出力する
fasta
フォーマット