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アセンブル , シーケンス , Assemble , Sequence , Hordeum marinum , Sea barleygrass , ハマムギクサ

Hordeum marinum

Genome Assembly ID:t4519.G001

配列名:GWHBJBH00000000.genome

ゲノム配列の詳細

ゲノム配列名 GWHBJBH00000000.genome 系統名 H559
配列数 1,197 染色体数 2n = 2x = 14
配列長 (bp) 3,815,965,547 N50長 (bp) 524,471,465
遺伝子の数 73,907 遺伝子数由来ファイル GWHBJBH00000000.Protein.faa.gz
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 0 Hayai-Annotation バージョン zen_v2.0
シーケンシングの方法 Illumina, PacBio, Hi-C 取得した配列量 789.1 Gb(Illumina), 325.3 Gb(PacBio), 434.9 Gb(Hi-C)
アセンブリ方法 FALCON 推定ゲノムサイズ (Mb) 4,200
シーケンシングの方法のコメント NA コメント NA
論文クレジット情報 準備中 データ/DB クレジット情報 準備中
責任著者 Guoping Zhang (Zhejiang University) データソース名 Genome Warehouse
論文 (DOIコード) 10.1016/j.xplc.2022.100333 データソースURL https://ngdc.cncb.ac.cn/gwh
BUSCO バージョン BUSCO データセット
BUSCO ゲノム BUSCO 遺伝子 (pep/cds)

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染色体 /
Scaffolds
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fasta
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