配列名:ASM9120v1
ゲノム配列名 | ASM9120v1 | 系統名 | strain 10D |
配列数 | 22 | 染色体数 | n = x = 20 |
配列長 (bp) | 16,728,945 | N50長 (bp) | 859,119 |
遺伝子の数 | 4,998 | 遺伝子数由来ファイル | Cyanidioschyzon_merolae.ASM9120v1.pep.all.fa |
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 | 4,998 | Hayai-Annotation バージョン | zen_v2.0 |
シーケンシングの方法 | WGS, BAC | 取得した配列量 | NA |
アセンブリ方法 | Arachne | 推定ゲノムサイズ (Mb) | 17 |
シーケンシングの方法のコメント | NA | コメント | NA |
論文クレジット情報 | 準備中 | データ/DB クレジット情報 | 準備中 |
責任著者 | Hisayoshi Nozaki (University of Tokyo) | データソース名 | Ensembl |
論文 (DOIコード) | 10.1186/1741-7007-5-28 | データソースURL | http://plants.ensembl.org/index.html |
BUSCO バージョン | 5.1.0 | BUSCO データセット | eukaryota_odb10 |
BUSCO ゲノム | C:73.0%[S:71.4%,D:1.6%],F:7.1%,M:19.9%,n:255 | BUSCO 遺伝子 (pep/cds) | C:71.4%[S:69.8%,D:1.6%],F:7.5%,M:21.1%,n:255 |