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アセンブル , シーケンス , Assemble , Sequence , Hordeum vulgare , Barley, Wild barley , オオムギ, シジョウオオムギ, オオムギ野生種

Hordeum vulgare

Genome Assembly ID:t4513.G006

配列名:Hvu_Hayakiso2_v1

ゲノム配列の詳細

ゲノム配列名 Hvu_Hayakiso2_v1 系統名 Hayakiso2
配列数 3,584 染色体数 2n = 2x = 14
配列長 (bp) 4,339,452,547 N50長 (bp) 615,397,350
遺伝子の数 55,477 遺伝子数由来ファイル Hvu_Hayakiso2_v1_pep.fa.gz
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 0 Hayai-Annotation バージョン zen_v2.0
シーケンシングの方法 PacBio Hifi, Illumina 取得した配列量 47.7x
アセンブリ方法 Hifiasm, ragtag, hypo 推定ゲノムサイズ (Mb) 5,100
シーケンシングの方法のコメント NA コメント NA
論文クレジット情報 準備中 データ/DB クレジット情報 準備中
責任著者 Tsuyoshi Tanaka (NARO) データソース名 Plant GARDEN
論文 (DOIコード) in preparation データソースURL https://plantgarden.jp/
BUSCO バージョン NA BUSCO データセット embryophyta_odb10
BUSCO ゲノム C:98.3%[S:94.5%,D:3.8%],F:1.0%,M:0.7%,n:1614,E:3.4% BUSCO 遺伝子 (pep/cds) C:97.3%[S:92.8%,D:4.5%],F:1.7%,M:1.0%,n:1614

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染色体 /
Scaffolds
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終了位置
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fasta
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