配列名:ASM2978338v1
| ゲノム配列名 | ASM2978338v1 | 系統名 | EC-N1 |
| 配列数 | 3,510 | 染色体数 | 2n = 2x = 14 |
| 配列長 (bp) | 5,193,531,093 | N50長 (bp) | 641,112,760 |
| 遺伝子の数 | 38,736 | 遺伝子数由来ファイル | EC-N1_pseudomolecules_V1.high_confidence.pep.fasta.gz |
| Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 | 0 | Hayai-Annotation バージョン | zen_v2.0 |
| シーケンシングの方法 | Oxford Nanopore, BioNano optical map, Hi-C | 取得した配列量 | 285.35 Gb (ONT), 311.01 Gb (BioNano), 514.5 Gb (Hi-C) |
| アセンブリ方法 | NextDenovo, BioNano Solve package v3.3, LACHESIS, Mummer v4.1 | 推定ゲノムサイズ (Mb) | 4,400 |
| シーケンシングの方法のコメント | NA | コメント | Hybrid scaffolds were assembled from ONT assembly and BioNano genome maps. |
| 論文クレジット情報 | 準備中 | データ/DB クレジット情報 | 準備中 |
| 責任著者 | Wenying Zhang (Yangtze University) | データソース名 | NCBI; Ffigshare |
| 論文 (DOIコード) | 10.1038/s41597-023-02434-2 | データソースURL | https://www.ncbi.nlm.nih.gov/assembly/GCA_029782615.1/?shouldredirect=false https://figshare.com/articles/dataset/Annotation_of_two_barley_genome/23501529/1?file=41218167 |
| BUSCO バージョン | 5.8.2 | BUSCO データセット | embryophyta_odb10 |
| BUSCO ゲノム | C:97.4%[S:80.7%,D:16.7%],F:0.9%,M:1.7%,n:1614 | BUSCO 遺伝子 (pep/cds) | C:95.0%[S:83.1%,D:11.9%],F:1.6%,M:3.3%,n:1614 |