配列名:ASM2978261v1
| ゲノム配列名 | ASM2978261v1 | 系統名 | EC-S1 |
| 配列数 | 3,224 | 染色体数 | 2n = 2x = 14 |
| 配列長 (bp) | 5,110,990,204 | N50長 (bp) | 668,540,849 |
| 遺伝子の数 | 39,178 | 遺伝子数由来ファイル | EC-S1_pseudomolecules_V1.high_confidence.pep.fasta.gz |
| Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 | 0 | Hayai-Annotation バージョン | zen_v2.0 |
| シーケンシングの方法 | Oxford Nanopore, Hi-C, BioNano optical mapping | 取得した配列量 | 295.6 Gb (ONT), 443.19 Gb (BioNano), 555.1 Gb (Hi-C) |
| アセンブリ方法 | NextDenovo, BioNano Solve package v3.3, LACHESIS, Mummer v4.0 | 推定ゲノムサイズ (Mb) | 4,560 |
| シーケンシングの方法のコメント | NA | コメント | Hybrid scaffolds were assembled from ONT assembly and BioNano genome maps. |
| 論文クレジット情報 | 準備中 | データ/DB クレジット情報 | 準備中 |
| 責任著者 | Wenying Zhang (Yangtze University) | データソース名 | NCBI; Ffigshare |
| 論文 (DOIコード) | 10.1038/s41597-023-02434-2 | データソースURL | https://www.ncbi.nlm.nih.gov/assembly/GCA_029782615.1/?shouldredirect=false https://figshare.com/articles/dataset/Annotation_of_two_barley_genome/23501529/1?file=41218167 |
| BUSCO バージョン | 5.8.2 | BUSCO データセット | embryophyta_odb10 |
| BUSCO ゲノム | C:97.2%[S:83.5%,D:13.7%],F:1.1%,M:1.7%,n:1614 | BUSCO 遺伝子 (pep/cds) | C:95.6%[S:85.9%,D:9.7%],F:1.2%,M:3.2%,n:1614 |