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アセンブル , シーケンス , Assemble , Sequence , Hordeum vulgare subsp. spontaneum , Barley, Wild barley (ssp. spontaneum) , オオムギ, シジョウオオムギ, オオムギ野生種 (spontaneum亜種)

Hordeum vulgare

Genome Assembly ID:t4513.G003

配列名:EC_N1

ゲノム配列の詳細

ゲノム配列名 EC_N1 系統名 EC-N1
配列数 3,511 染色体数 2n = 2x = 14
配列長 (bp) 5,218,716,962 N50長 (bp) 641,112,760
遺伝子の数 38,736 遺伝子数由来ファイル EC-N1_pseudomolecules_V1.high_confidence.pep.fasta.gz
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 0 Hayai-Annotation バージョン zen_v2.0
シーケンシングの方法 Oxford Nanopore 取得した配列量 285.4 Gb
アセンブリ方法 NextDenovo, BioNano Solve package v3.3, LACHESIS 推定ゲノムサイズ (Mb) NA
シーケンシングの方法のコメント NA コメント Hybrid scaffolds were assembled from ONT assembly and BioNano genome maps.
論文クレジット情報 準備中 データ/DB クレジット情報 準備中
責任著者 Chengdao Li (Murdoch University) データソース名 CNGBdb; Zenodo
論文 (DOIコード) 10.1111/pbi.13917 データソースURL https://db.cngb.org
https://zenodo.org
BUSCO バージョン BUSCO データセット
BUSCO ゲノム BUSCO 遺伝子 (pep/cds)

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染色体 /
Scaffolds
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fasta
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