配列名:Ragi PR202 v. 2.0
ゲノム配列名 | Ragi PR202 v. 2.0 | 系統名 | subsp. coracana, cv. PR202, IC number 479099 |
配列数 | 1,196 | 染色体数 | 2n = 4x = 36 |
配列長 (bp) | 1,229,373,533 | N50長 (bp) | 23,885,297 |
遺伝子の数 | 57,180 | 遺伝子数由来ファイル | GCA_021604985.1_Ragi_PR202_v._2.0_protein.faa.gz |
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 | 0 | Hayai-Annotation バージョン | zen_v2.0 |
シーケンシングの方法 | Illumina, PacBio RS II, Bionano optical map | 取得した配列量 | 140x (Illumina), 16x (PacBio) |
アセンブリ方法 | Platanus v1.2.4, DBG2OLC, SSPACE v3.0, IrysSolve_ v2.1 | 推定ゲノムサイズ (Mb) | 1,500 |
シーケンシングの方法のコメント | NA | コメント | Hybrid de novo assembly |
論文クレジット情報 | 準備中 | データ/DB クレジット情報 | 準備中 |
責任著者 | Kentaro K Shimizu (University of Zurich) | データソース名 | NCBI |
論文 (DOIコード) | 10.1093/dnares/dsx036 | データソースURL | https://www.ncbi.nlm.nih.gov/ |
BUSCO バージョン | BUSCO データセット | ||
BUSCO ゲノム | BUSCO 遺伝子 (pep/cds) |