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アセンブル , シーケンス , Assemble , Sequence , Eleusine coracana subsp. coracana , Finger millet (ssp. coracana) , シコクビエ (coracana亜種)

Eleusine coracana

Genome Assembly ID:t4511.G002

配列名:Ragi PR202 v. 2.0

ゲノム配列の詳細

ゲノム配列名 Ragi PR202 v. 2.0 系統名 subsp. coracana, cv. PR202, IC number 479099
配列数 1,196 染色体数 2n = 4x = 36
配列長 (bp) 1,229,373,533 N50長 (bp) 23,885,297
遺伝子の数 57,180 遺伝子数由来ファイル GCA_021604985.1_Ragi_PR202_v._2.0_protein.faa.gz
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 0 Hayai-Annotation バージョン zen_v2.0
シーケンシングの方法 Illumina, PacBio RS II, Bionano optical map 取得した配列量 140x (Illumina), 16x (PacBio)
アセンブリ方法 Platanus v1.2.4, DBG2OLC, SSPACE v3.0, IrysSolve_ v2.1 推定ゲノムサイズ (Mb) 1,500
シーケンシングの方法のコメント NA コメント Hybrid de novo assembly
論文クレジット情報 準備中 データ/DB クレジット情報 準備中
責任著者 Kentaro K Shimizu (University of Zurich) データソース名 NCBI
論文 (DOIコード) 10.1093/dnares/dsx036 データソースURL https://www.ncbi.nlm.nih.gov/
BUSCO バージョン BUSCO データセット
BUSCO ゲノム BUSCO 遺伝子 (pep/cds)

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染色体 /
Scaffolds
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fasta
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