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アセンブル , シーケンス , Assemble , Sequence , Eleusine coracana subsp. coracana , Finger millet (ssp. coracana) , シコクビエ (coracana亜種)

Eleusine coracana

Genome Assembly ID:t4511.G001

配列名:Eleusine coracana v1.1

ゲノム配列の詳細

ゲノム配列名 Eleusine coracana v1.1 系統名 subsp. coracana, cv. KNE 796
配列数 532 染色体数 2n = 4x = 36
配列長 (bp) 1,111,714,373 N50長 (bp) 61,270,980
遺伝子の数 48,836 遺伝子数由来ファイル Ecoracana_560_v1.1.protein_primaryTranscriptOnly.fa.gz
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 0 Hayai-Annotation バージョン zen_v2.0
シーケンシングの方法 PacBio Sequel I, Hi-C 取得した配列量 84.71x (PacBio), 164.2x (Hi-C)
アセンブリ方法 MECAT v1.4, JUICER v1.8.9, BWA-mem v0.7.17-r1188 推定ゲノムサイズ (Mb) 1,130
シーケンシングの方法のコメント NA コメント NA
論文クレジット情報 準備中 データ/DB クレジット情報 準備中
責任著者 Katrien M. Devos (University of Georgia) データソース名 Phytozome
論文 (DOIコード) 10.1038/s41467-023-38915-6 データソースURL https://phytozome.jgi.doe.gov/pz/portal.html
BUSCO バージョン BUSCO データセット
BUSCO ゲノム BUSCO 遺伝子 (pep/cds)

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染色体 /
Scaffolds
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fasta
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