配列名:Eleusine coracana v1.1
ゲノム配列名 | Eleusine coracana v1.1 | 系統名 | subsp. coracana, cv. KNE 796 |
配列数 | 532 | 染色体数 | 2n = 4x = 36 |
配列長 (bp) | 1,111,714,373 | N50長 (bp) | 61,270,980 |
遺伝子の数 | 48,836 | 遺伝子数由来ファイル | Ecoracana_560_v1.1.protein_primaryTranscriptOnly.fa.gz |
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 | 0 | Hayai-Annotation バージョン | zen_v2.0 |
シーケンシングの方法 | PacBio Sequel I, Hi-C | 取得した配列量 | 84.71x (PacBio), 164.2x (Hi-C) |
アセンブリ方法 | MECAT v1.4, JUICER v1.8.9, BWA-mem v0.7.17-r1188 | 推定ゲノムサイズ (Mb) | 1,130 |
シーケンシングの方法のコメント | NA | コメント | NA |
論文クレジット情報 | 準備中 | データ/DB クレジット情報 | 準備中 |
責任著者 | Katrien M. Devos (University of Georgia) | データソース名 | Phytozome |
論文 (DOIコード) | 10.1038/s41467-023-38915-6 | データソースURL | https://phytozome.jgi.doe.gov/pz/portal.html |
BUSCO バージョン | BUSCO データセット | ||
BUSCO ゲノム | BUSCO 遺伝子 (pep/cds) |