配列名:GWHAMJR00000000
ゲノム配列名 | GWHAMJR00000000 | 系統名 | var. sinensis, cv. Biyun |
配列数 | 3,783 | 染色体数 | 2n = 2x = 30 |
配列長 (bp) | 2,920,323,113 | N50長 (bp) | 195,678,510 |
遺伝子の数 | 40,808 | 遺伝子数由来ファイル | GWHAMJR00000000.Protein.faa.gz |
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 | 0 | Hayai-Annotation バージョン | zen_v2.0 |
シーケンシングの方法 | PacBio RSII, Hi-C | 取得した配列量 | 127.66x |
アセンブリ方法 | FALCON v3.1, BWA v0.7.7, LACHESIS, JUICERBOX | 推定ゲノムサイズ (Mb) | 3,250 |
シーケンシングの方法のコメント | NA | コメント | NA |
論文クレジット情報 | 準備中 | データ/DB クレジット情報 | 準備中 |
責任著者 | Li-Zhi Gao (South China Agricultural University) | データソース名 | Genome Warehouse |
論文 (DOIコード) | 10.1016/j.molp.2020.04.009 | データソースURL | https://bigd.big.ac.cn/gwh/ |
BUSCO バージョン | BUSCO データセット | ||
BUSCO ゲノム | BUSCO 遺伝子 (pep/cds) |