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アセンブル , シーケンス , Assemble , Sequence , Camellia sinensis var. sinensis , Tea, Black tea, Chinese Oolong tea (var. sinensis) , チャ, チャノキ (sinensis変種)

Camellia sinensis

Genome Assembly ID:t4442.G009

配列名:GWHAMJR00000000

ゲノム配列の詳細

ゲノム配列名 GWHAMJR00000000 系統名 var. sinensis, cv. Biyun
配列数 3,783 染色体数 2n = 2x = 30
配列長 (bp) 2,920,323,113 N50長 (bp) 195,678,510
遺伝子の数 40,808 遺伝子数由来ファイル GWHAMJR00000000.Protein.faa.gz
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 0 Hayai-Annotation バージョン zen_v2.0
シーケンシングの方法 PacBio RSII, Hi-C 取得した配列量 127.66x
アセンブリ方法 FALCON v3.1, BWA v0.7.7, LACHESIS, JUICERBOX 推定ゲノムサイズ (Mb) 3,250
シーケンシングの方法のコメント NA コメント NA
論文クレジット情報 準備中 データ/DB クレジット情報 準備中
責任著者 Li-Zhi Gao (South China Agricultural University) データソース名 Genome Warehouse
論文 (DOIコード) 10.1016/j.molp.2020.04.009 データソースURL https://bigd.big.ac.cn/gwh/
BUSCO バージョン BUSCO データセット
BUSCO ゲノム BUSCO 遺伝子 (pep/cds)

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染色体 /
Scaffolds
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fasta
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