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アセンブル , シーケンス , Assemble , Sequence , Camellia sinensis var. sinensis , Tea, Black tea, Chinese Oolong tea (var. sinensis) , チャ, チャノキ (sinensis変種)

Camellia sinensis

Genome Assembly ID:t4442.G008

配列名:GWHACFB00000000

ゲノム配列の詳細

ゲノム配列名 GWHACFB00000000 系統名 var. sinensis, cv. Longjin 43
配列数 30,544 染色体数 2n = 2x = 30
配列長 (bp) 3,260,671,035 N50長 (bp) 143,847,529
遺伝子の数 33,556 遺伝子数由来ファイル GWHACFB00000000.Protein.faa.gz
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 0 Hayai-Annotation バージョン zen_v2.0
シーケンシングの方法 PacBio RSII, Hi-C 取得した配列量 60x
アセンブリ方法 WTDBG v1.2.8, BWA-MEM v0.7.15 推定ゲノムサイズ (Mb) 3,320
シーケンシングの方法のコメント NA コメント NA
論文クレジット情報 準備中 データ/DB クレジット情報 準備中
責任著者 Yajun Yang (Chinese Academy of Agricultural Sciences) データソース名 Genome Warehouse
論文 (DOIコード) 10.1038/s41467-020-18228-8 データソースURL https://bigd.big.ac.cn/gwh/
BUSCO バージョン BUSCO データセット
BUSCO ゲノム BUSCO 遺伝子 (pep/cds)

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染色体 /
Scaffolds
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fasta
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