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アセンブル , シーケンス , Assemble , Sequence , Camellia sinensis var. sinensis , Tea, Black tea, Chinese Oolong tea (var. sinensis) , チャ, チャノキ (sinensis変種)

Camellia sinensis

Genome Assembly ID:t4442.G007

配列名:GWHBAUV00000000

ゲノム配列の詳細

ゲノム配列名 GWHBAUV00000000 系統名 var. sinensis, cv. Huangdan (HD)
配列数 43 染色体数 2n = 2x = 30
配列長 (bp) 5,879,548,707 N50長 (bp) 213,387,167
遺伝子の数 88,514 遺伝子数由来ファイル GWHBAUV00000000.Protein.faa.gz
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 0 Hayai-Annotation バージョン zen_v2.0
シーケンシングの方法 PacBio Sequel II, Hi-C 取得した配列量 18.67x (PacBio), 111.50x (Hi-C)
アセンブリ方法 Hifiasm, ALLHiC, RaGOO v1.1 推定ゲノムサイズ (Mb) 2,940
シーケンシングの方法のコメント NA コメント NA
論文クレジット情報 準備中 データ/DB クレジット情報 準備中
責任著者 Naixing Ye (Fujian Agriculture and Forestry University/Key Laboratory of Tea Science in Universities of Fujian Province) データソース名 Genome Warehouse
論文 (DOIコード) 10.1038/s41438-021-00542-x データソースURL https://bigd.big.ac.cn/gwh/
BUSCO バージョン BUSCO データセット
BUSCO ゲノム BUSCO 遺伝子 (pep/cds)

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染色体 /
Scaffolds
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fasta
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