配列名:GWHAZTZ00000000
ゲノム配列名 | GWHAZTZ00000000 | 系統名 | var. sinensis, cv. Huangdan (HD) |
配列数 | 913 | 染色体数 | 2n = 2x = 30 |
配列長 (bp) | 2,948,971,410 | N50長 (bp) | 213,274,022 |
遺伝子の数 | 43,779 | 遺伝子数由来ファイル | GWHAZTZ00000000.Protein.faa.gz |
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 | 0 | Hayai-Annotation バージョン | zen_v2.0 |
シーケンシングの方法 | PacBio Sequel II, Hi-C | 取得した配列量 | 18.67x (PacBio), 111.50x (Hi-C) |
アセンブリ方法 | Hifiasm, ALLHiC | 推定ゲノムサイズ (Mb) | 2,940 |
シーケンシングの方法のコメント | NA | コメント | NA |
論文クレジット情報 | 準備中 | データ/DB クレジット情報 | 準備中 |
責任著者 | Naixing Ye (Fujian Agriculture and Forestry University/Key Laboratory of Tea Science in Universities of Fujian Province) | データソース名 | Genome Warehouse |
論文 (DOIコード) | 10.1038/s41438-021-00542-x | データソースURL | https://bigd.big.ac.cn/gwh/ |
BUSCO バージョン | BUSCO データセット | ||
BUSCO ゲノム | BUSCO 遺伝子 (pep/cds) |