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アセンブル , シーケンス , Assemble , Sequence , Camellia sinensis var. Tieguanyin , Tea, Black tea, Chinese Oolong tea (var. Tieguanyin) , チャ, チャノキ (Tieguanyin変種)

Camellia sinensis

Genome Assembly ID:t4442.G005

配列名:GWHASIX00000000

ゲノム配列の詳細

ゲノム配列名 GWHASIX00000000 系統名 var. Tieguanyin
配列数 15,244 染色体数 2n = 2x = 30
配列長 (bp) 5,991,822,019 N50長 (bp) 206,237,967
遺伝子の数 52,620 遺伝子数由来ファイル GWHASIX00000000.Protein.faa.gz
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 0 Hayai-Annotation バージョン zen_v2.0
シーケンシングの方法 PacBio Sequel II, Illumina, Hi-C 取得した配列量 114x (PacBio), 58x (Illumina)
アセンブリ方法 Canu v1.9, ALLHiC 推定ゲノムサイズ (Mb) 3,150
シーケンシングの方法のコメント NA コメント NA
論文クレジット情報 準備中 データ/DB クレジット情報 準備中
責任著者 Minsheng You (Fujian Agriculture and Forestry University) データソース名 Genome Warehouse
論文 (DOIコード) 10.1038/s41588-021-00895-y データソースURL https://bigd.big.ac.cn/gwh/
BUSCO バージョン BUSCO データセット
BUSCO ゲノム BUSCO 遺伝子 (pep/cds)

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染色体 /
Scaffolds
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fasta
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