配列名:DASZ
ゲノム配列名 | DASZ | 系統名 | wild tea tree 'DASZ' |
配列数 | 1,231 | 染色体数 | 2n = 2x = 30 |
配列長 (bp) | 3,112,992,050 | N50長 (bp) | 204,210,610 |
遺伝子の数 | 33,021 | 遺伝子数由来ファイル | DASZ.Protein.faa |
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 | 33,021 | Hayai-Annotation バージョン | zen_v2.0 |
シーケンシングの方法 | PacBIO, illumina, Hi-C | 取得した配列量 | 100x |
アセンブリ方法 | Falcon v0.3.0, BWA MEM v0.7.16a, Pilon v1.22 | 推定ゲノムサイズ (Mb) | 3,000 |
シーケンシングの方法のコメント | NA | コメント | DASZ is an ancient tea tree found in wild condition (Mandani Village in Yunnan Province). |
論文クレジット情報 | 準備中 | データ/DB クレジット情報 | 準備中 |
責任著者 | Weiwei Wen (Huazhong Agricultural University) | データソース名 | figshare database (Assembly and annotation of DASZ genome) |
論文 (DOIコード) | 10.1038/s41467-020-17498-6 | データソースURL | https://doi.org/10.6084/m9.figshare.12560462.v1 |
BUSCO バージョン | 5.1.0 | BUSCO データセット | embryophyta_odb10 |
BUSCO ゲノム | C:98.0%[S:87.2%,D:10.8%],F:1.0%,M:1.0%,n:1614 | BUSCO 遺伝子 (pep/cds) | C:83.3%[S:77.8%,D:5.5%],F:7.2%,M:9.5%,n:1614 |