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アセンブル , シーケンス , Assemble , Sequence , Toona sinensis , Chinese mahogany , チャンチン

Toona sinensis

Genome Assembly ID:t443222.G001

配列名:Toona_sinensis.genome.V1

ゲノム配列の詳細

ゲノム配列名 Toona_sinensis.genome.V1 系統名 wild accession
配列数 156 染色体数 2n = 2x = 56
配列長 (bp) 596,664,386 N50長 (bp) 21,547,656
遺伝子の数 34,345 遺伝子数由来ファイル Toona_sinensis.gene.pep.gz
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 0 Hayai-Annotation バージョン zen_v2.0
シーケンシングの方法 Illumina, Oxford Nanopore, Hi-C 取得した配列量 86.22 Gb(Oxford Nanopore), 108.28 Gb(Illumina), 84.72 Gb(Hi-C)
アセンブリ方法 smartdenovo version 1.0 推定ゲノムサイズ (Mb) 559
シーケンシングの方法のコメント NA コメント NA
論文クレジット情報 準備中 データ/DB クレジット情報 準備中
責任著者 Chang-Qing Qu (Fuyang Normal University) データソース名 CNGBdb
論文 (DOIコード) 10.1111/1755-0998.13318 データソースURL https://db.cngb.org
BUSCO バージョン BUSCO データセット
BUSCO ゲノム BUSCO 遺伝子 (pep/cds)

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染色体 /
Scaffolds
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fasta
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