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アセンブル , シーケンス , Assemble , Sequence , Cucumis x hytivus , Cucumis x hytivus , Cucumis x hytivus

Cucumis x hytivus

Genome Assembly ID:t442738.G001

配列名:hystrix.genome

ゲノム配列の詳細

ゲノム配列名 hystrix.genome 系統名 Inbred lines: C. sativus L. var. Beijingjietou and C. hystrix Chakr.
配列数 2,268 染色体数 2n = 4x = 38
配列長 (bp) 297,502,135 N50長 (bp) 21,333,645
遺伝子の数 23,864 遺伝子数由来ファイル hystrix.pep.fa.gz
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 0 Hayai-Annotation バージョン zen_v2.0
シーケンシングの方法 PacBio Sequel 取得した配列量 69x
アセンブリ方法 Canu 推定ゲノムサイズ (Mb) 805
シーケンシングの方法のコメント NA コメント NA
論文クレジット情報 準備中 データ/DB クレジット情報 準備中
責任著者 Jinfeng Chen (Nanjing Agricultural University) データソース名 figshare
論文 (DOIコード) 10.1002/advs.202004222 データソースURL https://doi.org/10.6084/m9.figshare.13377671
BUSCO バージョン BUSCO データセット
BUSCO ゲノム BUSCO 遺伝子 (pep/cds)

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染色体 /
Scaffolds
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fasta
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