Plant GARDEN 使い方 ▶︎

JA

EN

アセンブル , シーケンス , Assemble , Sequence , Pyrus betulifolia , Wild pear (betulifolia) , ナシ野生種 (betulifolia種), トウマメナシ

Pyrus betulifolia

Genome Assembly ID:t436086.G001

配列名:pbetulifolia_v1.0

ゲノム配列の詳細

ゲノム配列名 pbetulifolia_v1.0 系統名 cv. Shanxi Duli
配列数 139 染色体数 2n = 2x = 34
配列長 (bp) 532,747,033 N50長 (bp) 28,122,385
遺伝子の数 59,552 遺伝子数由来ファイル GWHAAYT00000000.Protein.faa
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 59,552 Hayai-Annotation バージョン zen_v2.0
シーケンシングの方法 PacBio 取得した配列量 95.9x
アセンブリ方法 HGAP v. 1.0 推定ゲノムサイズ (Mb) 511
シーケンシングの方法のコメント NA コメント NA
論文クレジット情報 準備中 データ/DB クレジット情報 準備中
責任著者 Zhixi Tian (Chinese Academy of Sciences), Yufen Cao (Chinese Academy of Agricultural Sciences) データソース名 Genome Warehouse
論文 (DOIコード) 10.1111/pbi.13226. データソースURL https://bigd.big.ac.cn/gwh/
BUSCO バージョン 5.1.0 BUSCO データセット embryophyta_odb10
BUSCO ゲノム C:96.1%[S:59.3%,D:36.8%],F:1.6%,M:2.3%,n:1614 BUSCO 遺伝子 (pep/cds) C:94.4%[S:60.7%,D:33.7%],F:2.7%,M:2.9%,n:1614

遺伝子をさがす

ゲノム配列を切り出す

染色体 /
Scaffolds
開始位置
終了位置
相補鎖を出力する
fasta
フォーマット