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アセンブル , シーケンス , Assemble , Sequence , Pistacia integerrima , Zebrawood , Pistacia integerrima

Pistacia integerrima

Genome Assembly ID:t434235.G001

配列名:Pint_V1

ゲノム配列の詳細

ゲノム配列名 Pint_V1 系統名 male
配列数 33 染色体数 2n = 30
配列長 (bp) 474,763,776 N50長 (bp) 28,219,897
遺伝子の数 34,132 遺伝子数由来ファイル GCA_026225825.1_Pint_V1_protein.faa.gz
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 34,132 Hayai-Annotation バージョン zen_v2.0
シーケンシングの方法 10X Genomics, Oxford Nanopore, Hi-C 取得した配列量 NA
アセンブリ方法 Supernova 1.1.4, Dovetail HiRise, SHASTA 0.1.0, RaGOO v1.1 推定ゲノムサイズ (Mb) 507
シーケンシングの方法のコメント NA コメント NA
論文クレジット情報 準備中 データ/DB クレジット情報 準備中
責任著者 Richard Michelmore (University of California Davis) データソース名 NCBI
論文 (DOIコード) 10.1093/g3journal/jkac317 データソースURL https://www.ncbi.nlm.nih.gov/
BUSCO バージョン 5.8.2 BUSCO データセット embryophyta_odb10
BUSCO ゲノム C:98.8%[S:93.9%,D:4.9%],F:1.1%,M:0.2%,n:1614 BUSCO 遺伝子 (pep/cds) C:77.1%[S:73.8%,D:3.3%],F:16.1%,M:6.8%,n:1614

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染色体 /
Scaffolds
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fasta
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