Plant GARDEN 使い方 ▶︎

JA

EN

アセンブル , シーケンス , Assemble , Sequence , Pistacia integerrima , Zebrawood , Pistacia integerrima

Pistacia integerrima

Genome Assembly ID:t434235.G001

配列名:Pint_V1

ゲノム配列の詳細

ゲノム配列名 Pint_V1 系統名 male
配列数 33 染色体数 2n = 30
配列長 (bp) 474,763,776 N50長 (bp) 28,219,897
遺伝子の数 34,132 遺伝子数由来ファイル GCA_026225825.1_Pint_V1_protein.faa.gz
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 0 Hayai-Annotation バージョン zen_v2.0
シーケンシングの方法 10X Genomics, Oxford Nanopore, Hi-C 取得した配列量 NA
アセンブリ方法 Supernova 1.1.4, Dovetail HiRise, SHASTA 0.1.0, RaGOO v1.1 推定ゲノムサイズ (Mb) 507
シーケンシングの方法のコメント NA コメント NA
論文クレジット情報 準備中 データ/DB クレジット情報 準備中
責任著者 Richard Michelmore (University of California Davis) データソース名 NCBI
論文 (DOIコード) 10.1093/g3journal/jkac317 データソースURL https://www.ncbi.nlm.nih.gov/
BUSCO バージョン BUSCO データセット
BUSCO ゲノム BUSCO 遺伝子 (pep/cds)

遺伝子をさがす

遺伝子データは登録されていません。

ゲノム配列を切り出す

染色体 /
Scaffolds
開始位置
終了位置
相補鎖を出力する
fasta
フォーマット