配列名:Pint_V1
ゲノム配列名 | Pint_V1 | 系統名 | male |
配列数 | 33 | 染色体数 | 2n = 30 |
配列長 (bp) | 474,763,776 | N50長 (bp) | 28,219,897 |
遺伝子の数 | 34,132 | 遺伝子数由来ファイル | GCA_026225825.1_Pint_V1_protein.faa.gz |
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 | 34,132 | Hayai-Annotation バージョン | zen_v2.0 |
シーケンシングの方法 | 10X Genomics, Oxford Nanopore, Hi-C | 取得した配列量 | NA |
アセンブリ方法 | Supernova 1.1.4, Dovetail HiRise, SHASTA 0.1.0, RaGOO v1.1 | 推定ゲノムサイズ (Mb) | 507 |
シーケンシングの方法のコメント | NA | コメント | NA |
論文クレジット情報 | 準備中 | データ/DB クレジット情報 | 準備中 |
責任著者 | Richard Michelmore (University of California Davis) | データソース名 | NCBI |
論文 (DOIコード) | 10.1093/g3journal/jkac317 | データソースURL | https://www.ncbi.nlm.nih.gov/ |
BUSCO バージョン | 5.8.2 | BUSCO データセット | embryophyta_odb10 |
BUSCO ゲノム | C:98.8%[S:93.9%,D:4.9%],F:1.1%,M:0.2%,n:1614 | BUSCO 遺伝子 (pep/cds) | C:77.1%[S:73.8%,D:3.3%],F:16.1%,M:6.8%,n:1614 |