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アセンブル , シーケンス , Assemble , Sequence , Pistacia atlantica , Mt. Atlas mastic tree, Atlas pistachio, Atlantic terebinth, Cyprus turpentine tree, Persian turpentine tree , Pistacia atlantica

Pistacia atlantica

Genome Assembly ID:t434234.G001

配列名:Patl_V1

ゲノム配列の詳細

ゲノム配列名 Patl_V1 系統名 female
配列数 113 染色体数 2n = 30
配列長 (bp) 505,281,571 N50長 (bp) 29,993,599
遺伝子の数 34,842 遺伝子数由来ファイル GCA_026229545.1_Patl_V1_protein.faa.gz
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 0 Hayai-Annotation バージョン zen_v2.0
シーケンシングの方法 10X Genomics, Oxford Nanopore, Hi-C 取得した配列量 NA
アセンブリ方法 Supernova 1.1.4, Dovetail HiRise, SHASTA 0.1.0, RaGOO v1.1 推定ゲノムサイズ (Mb) 560
シーケンシングの方法のコメント NA コメント NA
論文クレジット情報 準備中 データ/DB クレジット情報 準備中
責任著者 Richard Michelmore (University of California Davis) データソース名 NCBI
論文 (DOIコード) 10.1093/g3journal/jkac317 データソースURL https://www.ncbi.nlm.nih.gov/
BUSCO バージョン BUSCO データセット
BUSCO ゲノム BUSCO 遺伝子 (pep/cds)

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染色体 /
Scaffolds
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終了位置
相補鎖を出力する
fasta
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