配列名:cutv01
ゲノム配列名 | cutv01 | 系統名 | cv. Black Seeded Simpson |
配列数 | 9 | 染色体数 | 2n = 2x = 18 |
配列長 (bp) | 2,580,594,989 | N50長 (bp) | 320,995,264 |
遺伝子の数 | 67,123 | 遺伝子数由来ファイル | cutv01.a01.pep.fa |
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 | 0 | Hayai-Annotation バージョン | zen_v2.0 |
シーケンシングの方法 | PacBio Sequel IIe, Oxford Nanopore, Hi-C | 取得した配列量 | 30x (PacBio), 30x (ONT), 27 Gb (ONT) |
アセンブリ方法 | Hifiasm v0.19.5, Juicer v1.6.2, 3D-DNA v180114, flye v2.9.2 | 推定ゲノムサイズ (Mb) | NA |
シーケンシングの方法のコメント | NA | コメント | NA |
論文クレジット情報 | 準備中 | データ/DB クレジット情報 | 準備中 |
責任著者 | Lisha Shen (National University of Singapore) | データソース名 | GIGA DB |
論文 (DOIコード) | 10.1093/gigascience/giae043 | データソースURL | http://gigadb.org/ |
BUSCO バージョン | BUSCO データセット | ||
BUSCO ゲノム | BUSCO 遺伝子 (pep/cds) |