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アセンブル , シーケンス , Assemble , Sequence , Lactuca sativa , Lettuce , レタス

Lactuca sativa

Genome Assembly ID:t4236.G004

配列名:cutv01

ゲノム配列の詳細

ゲノム配列名 cutv01 系統名 cv. Black Seeded Simpson
配列数 9 染色体数 2n = 2x = 18
配列長 (bp) 2,580,594,989 N50長 (bp) 320,995,264
遺伝子の数 67,123 遺伝子数由来ファイル cutv01.a01.pep.fa
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 0 Hayai-Annotation バージョン zen_v2.0
シーケンシングの方法 PacBio Sequel IIe, Oxford Nanopore, Hi-C 取得した配列量 30x (PacBio), 30x (ONT), 27 Gb (ONT)
アセンブリ方法 Hifiasm v0.19.5, Juicer v1.6.2, 3D-DNA v180114, flye v2.9.2 推定ゲノムサイズ (Mb) NA
シーケンシングの方法のコメント NA コメント NA
論文クレジット情報 準備中 データ/DB クレジット情報 準備中
責任著者 Lisha Shen (National University of Singapore) データソース名 GIGA DB
論文 (DOIコード) 10.1093/gigascience/giae043 データソースURL http://gigadb.org/
BUSCO バージョン BUSCO データセット
BUSCO ゲノム BUSCO 遺伝子 (pep/cds)

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染色体 /
Scaffolds
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