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アセンブル , シーケンス , Assemble , Sequence , Lactuca sativa , Lettuce , レタス

Lactuca sativa

Genome Assembly ID:t4236.G003

配列名:LsT2T

ゲノム配列の詳細

ゲノム配列名 LsT2T 系統名 cv. PKU06
配列数 9 染色体数 2n = 2x = 18
配列長 (bp) 2,593,462,933 N50長 (bp) 320,657,391
遺伝子の数 0 遺伝子数由来ファイル NA
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 0 Hayai-Annotation バージョン zen_v2.0
シーケンシングの方法 PacBio Sequel II, Oxford Nanopore, Hi-C 取得した配列量 112.4x (PacBio), 42.9x (ONT), 118.83x (Hi-C)
アセンブリ方法 Hifiasm v0.16.1, Juicer, 3D-DNA v180419 推定ゲノムサイズ (Mb) 2,700
シーケンシングの方法のコメント NA コメント NA
論文クレジット情報 準備中 データ/DB クレジット情報 準備中
責任著者 Li Guo (The Peking University Institute of Advanced Agricultural Sciences) データソース名 Figshare
論文 (DOIコード) 10.1016/j.xplc.2024.101011 データソースURL https://figshare.com
BUSCO バージョン BUSCO データセット
BUSCO ゲノム BUSCO 遺伝子 (pep/cds)

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染色体 /
Scaffolds
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fasta
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