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アセンブル , シーケンス , Assemble , Sequence , Lactuca sativa var. angustana , Lettuce , レタス (angustana変種)

Lactuca sativa

Genome Assembly ID:t4236.G002

配列名:Stem_lettuce_genome.v1.1

ゲノム配列の詳細

ゲノム配列名 Stem_lettuce_genome.v1.1 系統名 cv. YanLing
配列数 649 染色体数 2n = 2x = 18
配列長 (bp) 2,620,626,119 N50長 (bp) 332,303,623
遺伝子の数 0 遺伝子数由来ファイル Stem_lettuce_protein.v1.1c.fa
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 0 Hayai-Annotation バージョン zen_v2.0
シーケンシングの方法 PacBio RS II, BioNano optical mapping, Hi-C 取得した配列量 105x (PacBio), 119x (BioNano), 108x (Hi-C)
アセンブリ方法 Falcon v0.4, BioNano Solve v3.0.1, Juicer v1.5, 3D-DNA v201008 推定ゲノムサイズ (Mb) 2,540
シーケンシングの方法のコメント NA コメント NA
論文クレジット情報 準備中 データ/DB クレジット情報 準備中
責任著者 Xiaozeng Yang (Beijing Academy of Agriculture and Forestry Sciences) データソース名 LettuceGDB
論文 (DOIコード) 10.1038/s41467-023-40002-9 データソースURL https://lettucegdb.cm/
BUSCO バージョン BUSCO データセット
BUSCO ゲノム BUSCO 遺伝子 (pep/cds)

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染色体 /
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