配列名:Stem_lettuce_genome.v1.1
ゲノム配列名 | Stem_lettuce_genome.v1.1 | 系統名 | cv. YanLing |
配列数 | 649 | 染色体数 | 2n = 2x = 18 |
配列長 (bp) | 2,620,626,119 | N50長 (bp) | 332,303,623 |
遺伝子の数 | 0 | 遺伝子数由来ファイル | Stem_lettuce_protein.v1.1c.fa |
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 | 0 | Hayai-Annotation バージョン | zen_v2.0 |
シーケンシングの方法 | PacBio RS II, BioNano optical mapping, Hi-C | 取得した配列量 | 105x (PacBio), 119x (BioNano), 108x (Hi-C) |
アセンブリ方法 | Falcon v0.4, BioNano Solve v3.0.1, Juicer v1.5, 3D-DNA v201008 | 推定ゲノムサイズ (Mb) | 2,540 |
シーケンシングの方法のコメント | NA | コメント | NA |
論文クレジット情報 | 準備中 | データ/DB クレジット情報 | 準備中 |
責任著者 | Xiaozeng Yang (Beijing Academy of Agriculture and Forestry Sciences) | データソース名 | LettuceGDB |
論文 (DOIコード) | 10.1038/s41467-023-40002-9 | データソースURL | https://lettucegdb.cm/ |
BUSCO バージョン | BUSCO データセット | ||
BUSCO ゲノム | BUSCO 遺伝子 (pep/cds) |