配列名:Lsativa_467_v8
ゲノム配列名 | Lsativa_467_v8 | 系統名 | cv. Salinas |
配列数 | 10 | 染色体数 | 2n = 2x = 18 |
配列長 (bp) | 2,399,509,484 | N50長 (bp) | 257,910,700 |
遺伝子の数 | 62,656 | 遺伝子数由来ファイル | Lsativa_467_v5.protein.fa |
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 | 62,656 | Hayai-Annotation バージョン | zen_v2.0 |
シーケンシングの方法 | Illumina | 取得した配列量 | 72x |
アセンブリ方法 | SOAPdenovo v. 2, Hi-Rise v. 1 | 推定ゲノムサイズ (Mb) | 2,500 |
シーケンシングの方法のコメント | NA | コメント | NA |
論文クレジット情報 | 準備中 | データ/DB クレジット情報 | 準備中 |
責任著者 | Richard W. Michelmore (UC Davis Genome Center) | データソース名 | Phytozome |
論文 (DOIコード) | 10.1038/ncomms14953 | データソースURL | https://phytozome.jgi.doe.gov/pz/portal.html |
BUSCO バージョン | 5.1.0 | BUSCO データセット | embryophyta_odb10 |
BUSCO ゲノム | C:98.8%[S:96.5%,D:2.3%],F:0.3%,M:0.9%,n:1614 | BUSCO 遺伝子 (pep/cds) | C:98.8%[S:41.1%,D:57.7%],F:0.2%,M:1.0%,n:1614 |