配列名:palm_55x_up_171113_PBpolish2nd_filt_p
ゲノム配列名 | palm_55x_up_171113_PBpolish2nd_filt_p | 系統名 | Barhee BC4 |
配列数 | 2,391 | 染色体数 | 2n = 2x = 36 |
配列長 (bp) | 773,189,301 | N50長 (bp) | 4,728,343 |
遺伝子の数 | 48,801 | 遺伝子数由来ファイル | GCF_009389715.1_palm_55x_up_171113_PBpolish2nd_filt_p_protein.faa |
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 | 0 | Hayai-Annotation バージョン | zen_v2.0 |
シーケンシングの方法 | PacBio, Illumina | 取得した配列量 | 92.9x(PacBio), 13.8x(Illumina) |
アセンブリ方法 | FALCON-Unzip | 推定ゲノムサイズ (Mb) | 870-899 |
シーケンシングの方法のコメント | NA | コメント | NA |
論文クレジット情報 | 準備中 | データ/DB クレジット情報 | 準備中 |
責任著者 | Khaled M.A.Amiri (UAE University), Michael D. Purugganan (New York University) | データソース名 | NCBI |
論文 (DOIコード) | 10.1038/s41467-019-12604-9 | データソースURL | https://www.ncbi.nlm.nih.gov/ |
BUSCO バージョン | 5.1.0 | BUSCO データセット | embryophyta_odb10 |
BUSCO ゲノム | C:97.2%[S:85.1%,D:12.1%],F:1.4%,M:1.4%,n:1614 | BUSCO 遺伝子 (pep/cds) | C:98.2%[S:49.3%,D:48.9%],F:0.7%,M:1.1%,n:1614 |