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アセンブル , シーケンス , Assemble , Sequence , Phoenix dactylifera , Data plam , ナツメヤシ

Phoenix dactylifera

Genome Assembly ID:t42345.G001

配列名:palm_55x_up_171113_PBpolish2nd_filt_p

ゲノム配列の詳細

ゲノム配列名 palm_55x_up_171113_PBpolish2nd_filt_p 系統名 Barhee BC4
配列数 2,391 染色体数 2n = 2x = 36
配列長 (bp) 773,189,301 N50長 (bp) 4,728,343
遺伝子の数 48,801 遺伝子数由来ファイル GCF_009389715.1_palm_55x_up_171113_PBpolish2nd_filt_p_protein.faa
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 0 Hayai-Annotation バージョン zen_v2.0
シーケンシングの方法 PacBio, Illumina 取得した配列量 92.9x(PacBio), 13.8x(Illumina)
アセンブリ方法 FALCON-Unzip 推定ゲノムサイズ (Mb) 870-899
シーケンシングの方法のコメント NA コメント NA
論文クレジット情報 準備中 データ/DB クレジット情報 準備中
責任著者 Khaled M.A.Amiri (UAE University), Michael D. Purugganan (New York University) データソース名 NCBI
論文 (DOIコード) 10.1038/s41467-019-12604-9 データソースURL https://www.ncbi.nlm.nih.gov/
BUSCO バージョン 5.1.0 BUSCO データセット embryophyta_odb10
BUSCO ゲノム C:97.2%[S:85.1%,D:12.1%],F:1.4%,M:1.4%,n:1614 BUSCO 遺伝子 (pep/cds) C:98.2%[S:49.3%,D:48.9%],F:0.7%,M:1.1%,n:1614

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染色体 /
Scaffolds
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fasta
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