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アセンブル , シーケンス , Assemble , Sequence , Helianthus annuus , Sunflower , ヒマワリ

Helianthus annuus

Genome Assembly ID:t4232.G001

配列名:HanXRQr1.0

ゲノム配列の詳細

ゲノム配列名 HanXRQr1.0 系統名 XRQ
配列数 1,528 染色体数 2n = 2x = 34
配列長 (bp) 3,027,844,945 N50長 (bp) 178,899,001
遺伝子の数 52,191 遺伝子数由来ファイル Helianthus_annuus.HanXRQr1.0.pep.all.fa
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 52,191 Hayai-Annotation バージョン zen_v2.0
シーケンシングの方法 PacBio 取得した配列量 100x
アセンブリ方法 PBcR v. wgs-8.3rc1 推定ゲノムサイズ (Mb) 3,600
シーケンシングの方法のコメント NA コメント NA
論文クレジット情報 準備中 データ/DB クレジット情報 準備中
責任著者 NicolasB.Langlade (Centre national de la recherche scientifique (CNRS)) データソース名 Ensembl
論文 (DOIコード) 10.1038/nature22380 データソースURL http://plants.ensembl.org/index.html
BUSCO バージョン 5.1.0 BUSCO データセット embryophyta_odb10
BUSCO ゲノム C:97.6%[S:87.0%,D:10.6%],F:0.9%,M:1.5%,n:1614 BUSCO 遺伝子 (pep/cds) C:96.9%[S:86.5%,D:10.4%],F:1.5%,M:1.6%,n:1614

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染色体 /
Scaffolds
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終了位置
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fasta
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