配列名:HanXRQr1.0
ゲノム配列名 | HanXRQr1.0 | 系統名 | XRQ |
配列数 | 1,528 | 染色体数 | 2n = 2x = 34 |
配列長 (bp) | 3,027,844,945 | N50長 (bp) | 178,899,001 |
遺伝子の数 | 52,191 | 遺伝子数由来ファイル | Helianthus_annuus.HanXRQr1.0.pep.all.fa |
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 | 52,191 | Hayai-Annotation バージョン | zen_v2.0 |
シーケンシングの方法 | PacBio | 取得した配列量 | 100x |
アセンブリ方法 | PBcR v. wgs-8.3rc1 | 推定ゲノムサイズ (Mb) | 3,600 |
シーケンシングの方法のコメント | NA | コメント | NA |
論文クレジット情報 | 準備中 | データ/DB クレジット情報 | 準備中 |
責任著者 | NicolasB.Langlade (Centre national de la recherche scientifique (CNRS)) | データソース名 | Ensembl |
論文 (DOIコード) | 10.1038/nature22380 | データソースURL | http://plants.ensembl.org/index.html |
BUSCO バージョン | 5.1.0 | BUSCO データセット | embryophyta_odb10 |
BUSCO ゲノム | C:97.6%[S:87.0%,D:10.6%],F:0.9%,M:1.5%,n:1614 | BUSCO 遺伝子 (pep/cds) | C:96.9%[S:86.5%,D:10.4%],F:1.5%,M:1.6%,n:1614 |