Plant GARDEN 使い方 ▶︎

JA

EN

アセンブル , シーケンス , Assemble , Sequence , Prunus avium , Sweet cherry , セイヨウミザクラ

Prunus avium

Genome Assembly ID:t42229.G004

配列名:pa_BigStar_v1.0

ゲノム配列の詳細

ゲノム配列名 pa_BigStar_v1.0 系統名 cv. Big Star
配列数 1,875 染色体数 2n = 2x = 16
配列長 (bp) 271,648,924 N50長 (bp) 26,086,129
遺伝子の数 50,482 遺伝子数由来ファイル CHERRY.prot.gz
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 0 Hayai-Annotation バージョン zen_v2.0
シーケンシングの方法 Illumina 取得した配列量 NA
アセンブリ方法 allpaths-lg version 50900 推定ゲノムサイズ (Mb) 322
シーケンシングの方法のコメント NA コメント NA
論文クレジット情報 準備中 データ/DB クレジット情報 準備中
責任著者 Sara Pinosio (Institute of Biosciences and Bioresources) データソース名 GDR: Genome Database For Rosaceae
論文 (DOIコード) 10.1111/tpj.14809 データソースURL https://www.rosaceae.org/
BUSCO バージョン BUSCO データセット
BUSCO ゲノム BUSCO 遺伝子 (pep/cds)

遺伝子をさがす

遺伝子データは登録されていません。

ゲノム配列を切り出す

染色体 /
Scaffolds
開始位置
終了位置
相補鎖を出力する
fasta
フォーマット