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アセンブル , シーケンス , Assemble , Sequence , Prunus avium , Sweet cherry , セイヨウミザクラ

Prunus avium

Genome Assembly ID:t42229.G002

配列名:Prunus avium Tieton Genome v1.0

ゲノム配列の詳細

ゲノム配列名 Prunus avium Tieton Genome v1.0 系統名 cv. Tieton
配列数 8 染色体数 2n = 2x = 16
配列長 (bp) 214,319,605 N50長 (bp) 25,477,979
遺伝子の数 30,975 遺伝子数由来ファイル Prunus_avium_Tieton_protein.fa.gz
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 0 Hayai-Annotation バージョン zen_v2.0
シーケンシングの方法 illumina 取得した配列量 NA
アセンブリ方法 Supernova v2.0 推定ゲノムサイズ (Mb) 341.34 (37-nt k-mer)
シーケンシングの方法のコメント NA コメント NA
論文クレジット情報 準備中 データ/DB クレジット情報 準備中
責任著者 Weizhen Liu (Wuhan University of Technology), Qingzhong Liu (Shandong Institute of Pomology) データソース名 GDR: Genome Database For Rosaceae
論文 (DOIコード) 10.7717/peerj.9114 データソースURL https://www.rosaceae.org/
BUSCO バージョン 5.1.0 BUSCO データセット embryophyta_odb10
BUSCO ゲノム C:94.0%[S:92.2%,D:1.8%],F:1.2%,M:4.8%,n:1614 BUSCO 遺伝子 (pep/cds) C:95.0%[S:90.4%,D:4.6%],F:2.9%,M:2.1%,n:1614

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染色体 /
Scaffolds
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fasta
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