配列名:Prunus avium Tieton Genome v1.0
ゲノム配列名 | Prunus avium Tieton Genome v1.0 | 系統名 | cv. Tieton |
配列数 | 8 | 染色体数 | 2n = 2x = 16 |
配列長 (bp) | 214,319,605 | N50長 (bp) | 25,477,979 |
遺伝子の数 | 30,975 | 遺伝子数由来ファイル | Prunus_avium_Tieton_protein.fa.gz |
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 | 0 | Hayai-Annotation バージョン | zen_v2.0 |
シーケンシングの方法 | illumina | 取得した配列量 | NA |
アセンブリ方法 | Supernova v2.0 | 推定ゲノムサイズ (Mb) | 341.34 (37-nt k-mer) |
シーケンシングの方法のコメント | NA | コメント | NA |
論文クレジット情報 | 準備中 | データ/DB クレジット情報 | 準備中 |
責任著者 | Weizhen Liu (Wuhan University of Technology), Qingzhong Liu (Shandong Institute of Pomology) | データソース名 | GDR: Genome Database For Rosaceae |
論文 (DOIコード) | 10.7717/peerj.9114 | データソースURL | https://www.rosaceae.org/ |
BUSCO バージョン | 5.1.0 | BUSCO データセット | embryophyta_odb10 |
BUSCO ゲノム | C:94.0%[S:92.2%,D:1.8%],F:1.2%,M:4.8%,n:1614 | BUSCO 遺伝子 (pep/cds) | C:95.0%[S:90.4%,D:4.6%],F:2.9%,M:2.1%,n:1614 |