配列名:PAV_r1.0
ゲノム配列名 | PAV_r1.0 | 系統名 | cv. Satonishiki |
配列数 | 9 | 染色体数 | 2n = 2x = 16 |
配列長 (bp) | 373,751,615 | N50長 (bp) | 43,232,855 |
遺伝子の数 | 43,673 | 遺伝子数由来ファイル | PAV_r1.0.proteins.fasta |
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 | 43,673 | Hayai-Annotation バージョン | zen_v2.0 |
シーケンシングの方法 | Illumina | 取得した配列量 | 327x |
アセンブリ方法 | SOAPdenovo v. 2-rev240, GapCloser v. 1.10 | 推定ゲノムサイズ (Mb) | 353 |
シーケンシングの方法のコメント | NA | コメント | NA |
論文クレジット情報 | 準備中 | データ/DB クレジット情報 | 準備中 |
責任著者 | Kenta Shirasawa (Kazusa DNA Research Institute) | データソース名 | DBcherry |
論文 (DOIコード) | 10.1093/dnares/dsx020 | データソースURL | http://cherry.kazusa.or.jp/ |
BUSCO バージョン | 5.1.0 | BUSCO データセット | embryophyta_odb10 |
BUSCO ゲノム | C:97.5%[S:94.2%,D:3.3%],F:1.6%,M:0.9%,n:1614 | BUSCO 遺伝子 (pep/cds) | C:83.4%[S:80.8%,D:2.6%],F:6.8%,M:9.8%,n:1614 |