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アセンブル , シーケンス , Assemble , Sequence , Prunus avium , Sweet cherry , セイヨウミザクラ

Prunus avium

Genome Assembly ID:t42229.G001

配列名:PAV_r1.0

ゲノム配列の詳細

ゲノム配列名 PAV_r1.0 系統名 cv. Satonishiki
配列数 9 染色体数 2n = 2x = 16
配列長 (bp) 373,751,615 N50長 (bp) 43,232,855
遺伝子の数 43,673 遺伝子数由来ファイル PAV_r1.0.proteins.fasta
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 43,673 Hayai-Annotation バージョン zen_v2.0
シーケンシングの方法 Illumina 取得した配列量 327x
アセンブリ方法 SOAPdenovo v. 2-rev240, GapCloser v. 1.10 推定ゲノムサイズ (Mb) 353
シーケンシングの方法のコメント NA コメント NA
論文クレジット情報 準備中 データ/DB クレジット情報 準備中
責任著者 Kenta Shirasawa (Kazusa DNA Research Institute) データソース名 DBcherry
論文 (DOIコード) 10.1093/dnares/dsx020 データソースURL http://cherry.kazusa.or.jp/
BUSCO バージョン 5.1.0 BUSCO データセット embryophyta_odb10
BUSCO ゲノム C:97.5%[S:94.2%,D:3.3%],F:1.6%,M:0.9%,n:1614 BUSCO 遺伝子 (pep/cds) C:83.4%[S:80.8%,D:2.6%],F:6.8%,M:9.8%,n:1614

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染色体 /
Scaffolds
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終了位置
相補鎖を出力する
fasta
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