Plant GARDEN 使い方 ▶︎

JA

EN

アセンブル , シーケンス , Assemble , Sequence , Carthamus tinctorius , Safflower , ベニバナ

Carthamus tinctorius

Genome Assembly ID:t4222.G001

配列名:Saf_v1

ゲノム配列の詳細

ゲノム配列名 Saf_v1 系統名 cv. Anhui-1
配列数 12 染色体数 2n = 2x = 24
配列長 (bp) 1,057,115,866 N50長 (bp) 88,212,955
遺伝子の数 45,331 遺伝子数由来ファイル Saf_v1_peps.fasta.gz
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 0 Hayai-Annotation バージョン zen_v2.0
シーケンシングの方法 PacBio Sequel 取得した配列量 188x
アセンブリ方法 Canu v1.3 推定ゲノムサイズ (Mb) 1,170
シーケンシングの方法のコメント NA コメント NA
論文クレジット情報 準備中 データ/DB クレジット情報 準備中
責任著者 Rui Qin (South-Central University for Nationalities) データソース名 The Genome Database of Carthamus tinctorius
論文 (DOIコード) 10.1111/pbi.13586 データソースURL https://safflower.scuec.edu.cn/index.html
BUSCO バージョン BUSCO データセット
BUSCO ゲノム BUSCO 遺伝子 (pep/cds)

遺伝子をさがす

遺伝子データは登録されていません。

ゲノム配列を切り出す

染色体 /
Scaffolds
開始位置
終了位置
相補鎖を出力する
fasta
フォーマット