Plant GARDEN 使い方 ▶︎

JA

EN

アセンブル , シーケンス , Assemble , Sequence , Sesamum indicum , Sesame , ゴマ, 栽培ゴマ, ゴマ栽培種 (indicum種)

Sesamum indicum

Genome Assembly ID:t4182.G003

配列名:Simas_v1.0

ゲノム配列の詳細

ゲノム配列名 Simas_v1.0 系統名 Masekin
配列数 98 染色体数 2n = 2x = 26
配列長 (bp) 283,649,636 N50長 (bp) 9,004,982
遺伝子の数 24,106 遺伝子数由来ファイル S.indicum_ssp.indicum_Masekin_annotation_v1.0_protein.fa
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 0 Hayai-Annotation バージョン zen_v2.0
シーケンシングの方法 Illumina PE, Nanopore ONT 取得した配列量 209x
アセンブリ方法 Nextdenovo v2.5.0; NextPolish v1.4.0 推定ゲノムサイズ (Mb) 342
シーケンシングの方法のコメント コメント
論文クレジット情報 準備中 データ/DB クレジット情報 準備中
責任著者 Masayuki Yamamoto (Toyama University) データソース名 Plant GARDEN
論文 (DOIコード) データソースURL https://plantgarden.jp/
BUSCO バージョン 5.4.3 BUSCO データセット eudicots_odb10
BUSCO ゲノム C:98.3%[S:93.4%,D:4.9%],F:0.6%,M:1.1%,n:2326 BUSCO 遺伝子 (pep/cds) NA

遺伝子をさがす

遺伝子データは登録されていません。

ゲノム配列を切り出す

ゲノム配列データは登録されていません。