配列名:S_indicum_v1.0
ゲノム配列名 | S_indicum_v1.0 | 系統名 | cv. Zhongzhi No. 13 |
配列数 | 16,236 | 染色体数 | 2n = 2x = 32 |
配列長 (bp) | 275,059,498 | N50長 (bp) | 17,356,267 |
遺伝子の数 | 35,410 | 遺伝子数由来ファイル | GCF_000512975.1_S_indicum_v1.0_protein.faa |
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 | 35,410 | Hayai-Annotation バージョン | zen_v2.0 |
シーケンシングの方法 | Illumina | 取得した配列量 | 152.7x |
アセンブリ方法 | SOAPdenovo v. 1.06 | 推定ゲノムサイズ (Mb) | 357 |
シーケンシングの方法のコメント | NA | コメント | NA |
論文クレジット情報 | 準備中 | データ/DB クレジット情報 | 準備中 |
責任著者 | Shengyi Liu (Oil Crops Research Institute of the Chinese Academy of Agricultural Sciences), Xiurong Zhang (ditto), Rajeev K Varshney (International Crops Research Institute for the Semi-Arid Tropics), Jun Wang (Beijing Genomics Institute (BGI) - Shenzhen) | データソース名 | NCBI |
論文 (DOIコード) | 10.1186/gb-2014-15-2-r39 | データソースURL | https://www.ncbi.nlm.nih.gov/ |
BUSCO バージョン | 5.1.0 | BUSCO データセット | embryophyta_odb10 |
BUSCO ゲノム | C:98.4%[S:95.2%,D:3.2%],F:0.8%,M:0.8%,n:1614 | BUSCO 遺伝子 (pep/cds) | C:98.9%[S:63.8%,D:35.1%],F:0.5%,M:0.6%,n:1614 |