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アセンブル , シーケンス , Assemble , Sequence , Sesamum indicum , Sesame , ゴマ

Sesamum indicum

Genome Assembly ID:t4182.G001

配列名:S_indicum_v1.0

ゲノム配列の詳細

ゲノム配列名 S_indicum_v1.0 系統名 cv. Zhongzhi No. 13
配列数 16,236 染色体数 2n = 2x = 32
配列長 (bp) 275,059,498 N50長 (bp) 17,356,267
遺伝子の数 35,410 遺伝子数由来ファイル GCF_000512975.1_S_indicum_v1.0_protein.faa
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 35,410 Hayai-Annotation バージョン zen_v2.0
シーケンシングの方法 Illumina 取得した配列量 152.7x
アセンブリ方法 SOAPdenovo v. 1.06 推定ゲノムサイズ (Mb) 357
シーケンシングの方法のコメント NA コメント NA
論文クレジット情報 準備中 データ/DB クレジット情報 準備中
責任著者 Shengyi Liu (Oil Crops Research Institute of the Chinese Academy of Agricultural Sciences), Xiurong Zhang (ditto), Rajeev K Varshney (International Crops Research Institute for the Semi-Arid Tropics), Jun Wang (Beijing Genomics Institute (BGI) - Shenzhen) データソース名 NCBI
論文 (DOIコード) 10.1186/gb-2014-15-2-r39 データソースURL https://www.ncbi.nlm.nih.gov/
BUSCO バージョン 5.1.0 BUSCO データセット embryophyta_odb10
BUSCO ゲノム C:98.4%[S:95.2%,D:3.2%],F:0.8%,M:0.8%,n:1614 BUSCO 遺伝子 (pep/cds) C:98.9%[S:63.8%,D:35.1%],F:0.5%,M:0.6%,n:1614

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染色体 /
Scaffolds
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fasta
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