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アセンブル , シーケンス , Assemble , Sequence , Antirrhinum majus , Snapdragon , キンギョソウ

Antirrhinum majus

Genome Assembly ID:t4151.G001

配列名:Amajus.IGDBv3

ゲノム配列の詳細

ゲノム配列名 Amajus.IGDBv3 系統名 cv. JI7
配列数 8 染色体数 2n = 2x = 16
配列長 (bp) 500,653,912 N50長 (bp) 63,869,611
遺伝子の数 51,479 遺伝子数由来ファイル Amajus.IGDBv3.pros.fasta
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 51,479 Hayai-Annotation バージョン zen_v2.0
シーケンシングの方法 Illumina, PacBIO, Hi-C, 10X 取得した配列量 174x
アセンブリ方法 Canu 推定ゲノムサイズ (Mb) 520
シーケンシングの方法のコメント NA コメント NA
論文クレジット情報 準備中 データ/DB クレジット情報 準備中
責任著者 Chengzhi Liang (University of Chinese Academy of Sciences), Yongbiao Xue (ditto), Ye Yin (BGI-Shenzhen), Enrico Coen (John Innes Centre) データソース名 Snapdragon Genome Database
論文 (DOIコード) 10.1038/s41477-018-0349-9 データソースURL http://bioinfo.sibs.ac.cn/Am/index.php
BUSCO バージョン 5.1.0 BUSCO データセット embryophyta_odb10
BUSCO ゲノム C:98.7%[S:96.5%,D:2.2%],F:0.6%,M:0.7%,n:1614 BUSCO 遺伝子 (pep/cds) C:94.6%[S:77.7%,D:16.9%],F:3.2%,M:2.2%,n:1614

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染色体 /
Scaffolds
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終了位置
相補鎖を出力する
fasta
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