配列名:Amajus.IGDBv3
ゲノム配列名 | Amajus.IGDBv3 | 系統名 | cv. JI7 |
配列数 | 8 | 染色体数 | 2n = 2x = 16 |
配列長 (bp) | 500,653,912 | N50長 (bp) | 63,869,611 |
遺伝子の数 | 51,479 | 遺伝子数由来ファイル | Amajus.IGDBv3.pros.fasta |
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 | 51,479 | Hayai-Annotation バージョン | zen_v2.0 |
シーケンシングの方法 | Illumina, PacBIO, Hi-C, 10X | 取得した配列量 | 174x |
アセンブリ方法 | Canu | 推定ゲノムサイズ (Mb) | 520 |
シーケンシングの方法のコメント | NA | コメント | NA |
論文クレジット情報 | 準備中 | データ/DB クレジット情報 | 準備中 |
責任著者 | Chengzhi Liang (University of Chinese Academy of Sciences), Yongbiao Xue (ditto), Ye Yin (BGI-Shenzhen), Enrico Coen (John Innes Centre) | データソース名 | Snapdragon Genome Database |
論文 (DOIコード) | 10.1038/s41477-018-0349-9 | データソースURL | http://bioinfo.sibs.ac.cn/Am/index.php |
BUSCO バージョン | 5.1.0 | BUSCO データセット | embryophyta_odb10 |
BUSCO ゲノム | C:98.7%[S:96.5%,D:2.2%],F:0.6%,M:0.7%,n:1614 | BUSCO 遺伝子 (pep/cds) | C:94.6%[S:77.7%,D:16.9%],F:3.2%,M:2.2%,n:1614 |