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アセンブル , シーケンス , Assemble , Sequence , Atractylodes lancea , Southern Tsangshu, Southern Tsangshu , ソウジュツ, ホソバオケラ

Atractylodes lancea

Genome Assembly ID:t41486.G003

配列名:ATLh2v3

ゲノム配列の詳細

ゲノム配列名 ATLh2v3 系統名 Y-T16-69
配列数 138 染色体数 2n = 2x = 24-26
配列長 (bp) 4,704,200,241 N50長 (bp) 375,108,488
遺伝子の数 75,682 遺伝子数由来ファイル ATLh2v3_helixer.pep.fa
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 0 Hayai-Annotation バージョン zen_v2.0
シーケンシングの方法 PacBio Hifi, Omni-C, Bionano 取得した配列量 34.1X
アセンブリ方法 Hifiasm v0.16.1, OGM. YaHS 推定ゲノムサイズ (Mb) 4,300
シーケンシングの方法のコメント NA コメント Haploid resolved genome (hap2)
論文クレジット情報 準備中 データ/DB クレジット情報 準備中
責任著者 Takahiro Tsusaka (Tsumura & Co) データソース名
論文 (DOIコード) in preparation データソースURL
BUSCO バージョン 5.5.0 BUSCO データセット embryophyta_odb10
BUSCO ゲノム C:98.7%[S:88.7%,D:10.0%],F:0.6%,M:0.7%,n:1614 BUSCO 遺伝子 (pep/cds) C:93.9%[S:85.6%,D:8.3%],F:3.8%,M:2.3%,n:1614

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染色体 /
Scaffolds
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fasta
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