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アセンブル , シーケンス , Assemble , Sequence , Atractylodes lancea , Southern Tsangshu, Southern Tsangshu , ソウジュツ, ホソバオケラ

Atractylodes lancea

Genome Assembly ID:t41486.G001

配列名:ATLpv3

ゲノム配列の詳細

ゲノム配列名 ATLpv3 系統名 Y-T16-69
配列数 1,077 染色体数 2n = 2x = 24-26
配列長 (bp) 4,791,082,237 N50長 (bp) 337,946,156
遺伝子の数 90,695 遺伝子数由来ファイル ATLpv3_helixer.pep.fa
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 0 Hayai-Annotation バージョン zen_v2.0
シーケンシングの方法 PacBio Hifi, Omni-C, Bionano 取得した配列量 34.1X
アセンブリ方法 Hifiasm v0.16.1, OGM. YaHS 推定ゲノムサイズ (Mb) 4,300
シーケンシングの方法のコメント NA コメント Unphased genome
論文クレジット情報 準備中 データ/DB クレジット情報 準備中
責任著者 Takahiro Tsusaka (Tsumura & Co) データソース名
論文 (DOIコード) in preparation データソースURL
BUSCO バージョン 5.5.0 BUSCO データセット embryophyta_odb10
BUSCO ゲノム C:98.9%[S:85.8%,D:13.1%],F:0.6%,M:0.5%,n:1614 BUSCO 遺伝子 (pep/cds) C:93.9%[S:82.2%,D:11.7%],F:3.7%,M:2.4%,n:1614

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染色体 /
Scaffolds
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終了位置
相補鎖を出力する
fasta
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