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アセンブル , シーケンス , Assemble , Sequence , Tectona grandis , Teak , チーク

Tectona grandis

Genome Assembly ID:t41396.G002

配列名:teak_tectona_grandis_26Jun2018_7GlFM_fmt_tp

ゲノム配列の詳細

ゲノム配列名 teak_tectona_grandis_26Jun2018_7GlFM_fmt_tp 系統名 NA
配列数 936 染色体数 2n = 2x = 36
配列長 (bp) 338,300,341 N50長 (bp) 16,483,567
遺伝子の数 31,168 遺伝子数由来ファイル teak_repr_hc_models_HiC.pep_con_sorted_modiGeneID.fa.gz
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 0 Hayai-Annotation バージョン zen_v2.0
シーケンシングの方法 PacBio) RSII, Sequel, Hi-C 取得した配列量 104x
アセンブリ方法 Canu v1.6, HiRise 推定ゲノムサイズ (Mb) 325
シーケンシングの方法のコメント NA コメント NA
論文クレジット情報 準備中 データ/DB クレジット情報 準備中
責任著者 C Robin Buell (Michigan State University) データソース名 DRYAD
論文 (DOIコード) 10.1093/gigascience/giz005 データソースURL https://datadryad.org
BUSCO バージョン BUSCO データセット
BUSCO ゲノム BUSCO 遺伝子 (pep/cds)

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染色体 /
Scaffolds
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fasta
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