Plant GARDEN 使い方 ▶︎

JA

EN

アセンブル , シーケンス , Assemble , Sequence , Plectranthus barbatus , Coleus , コレウス・フォルスコリ

Plectranthus barbatus

Genome Assembly ID:t41228.G001

配列名:PLBA

ゲノム配列の詳細

ゲノム配列名 PLBA 系統名 NA
配列数 62,959 染色体数 NA
配列長 (bp) 1,249,907,925 N50長 (bp) 258,138
遺伝子の数 413,222 遺伝子数由来ファイル PLBA_chr_aug_preds.aa.gz
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 0 Hayai-Annotation バージョン zen_v2.0
シーケンシングの方法 10x Genomics 取得した配列量 42.62x
アセンブリ方法 10x Supernova v2.1.1 推定ゲノムサイズ (Mb) 1,530
シーケンシングの方法のコメント NA コメント Synonym: Coleus barbatus, Coleus forskohlii
論文クレジット情報 準備中 データ/DB クレジット情報 準備中
責任著者 Bjoern Hamberger (Michigan State University) データソース名 DRYAD
論文 (DOIコード) 10.1038/s41467-023-35845-1 データソースURL https://datadryad.org
BUSCO バージョン BUSCO データセット
BUSCO ゲノム BUSCO 遺伝子 (pep/cds)

遺伝子をさがす

遺伝子データは登録されていません。

ゲノム配列を切り出す

染色体 /
Scaffolds
開始位置
終了位置
相補鎖を出力する
fasta
フォーマット