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アセンブル , シーケンス , Assemble , Sequence , Ipomoea batatas , Sweet potato , サツマイモ

Ipomoea batatas

Genome Assembly ID:t4120.G002

配列名:ipoBat4

ゲノム配列の詳細

ゲノム配列名 ipoBat4 系統名 cv. Taizhong6, accession number 2013003
配列数 28,464 染色体数 2n = 6x = 90
配列長 (bp) 837,061,592 N50長 (bp) 41,463,214
遺伝子の数 78,781 遺伝子数由来ファイル ipoBat4.transcript.fa
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 0 Hayai-Annotation バージョン zen_v2.0
シーケンシングの方法 Illumina 取得した配列量 NA
アセンブリ方法 IDBA-UD, Newbler 3.0, PLATANUS, SSPACE 推定ゲノムサイズ (Mb) NA
シーケンシングの方法のコメント NA コメント NA
論文クレジット情報 準備中 データ/DB クレジット情報 準備中
責任著者 Martin Vingron (Max Planck Institute for Molecular Genetics) データソース名 sweet potato genome browser
論文 (DOIコード) 10.1038/s41477-017-0002-z データソースURL http://public-genomes-ngs.molgen.mpg.de/SweetPotato/
BUSCO バージョン BUSCO データセット
BUSCO ゲノム BUSCO 遺伝子 (pep/cds)

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染色体 /
Scaffolds
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fasta
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