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アセンブル , シーケンス , Assemble , Sequence , Ipomoea batatas , Sweet potato , サツマイモ

Ipomoea batatas

Genome Assembly ID:t4120.G001

配列名:IBA_r1.0

ゲノム配列の詳細

ゲノム配列名 IBA_r1.0 系統名 Xushu 18
配列数 109,986 染色体数 2n = 6x = 90
配列長 (bp) 2,907,375,442 N50長 (bp) 23,279,505
遺伝子の数 175,633 遺伝子数由来ファイル IBA_r1.0.complete.cds.fa
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 175,748 Hayai-Annotation バージョン zen_v2.0
シーケンシングの方法 Illumina PE, MP, 10X Genomics, PacBio 取得した配列量 365.8x
アセンブリ方法 Denovo MAGIC 3, Linkage map 推定ゲノムサイズ (Mb) 2,604
シーケンシングの方法のコメント NA コメント NA
論文クレジット情報 準備中 データ/DB クレジット情報 準備中
責任著者 Sachiko Isobe (Kazusa DNA Res Inst) データソース名 Plant GARDEN
論文 (DOIコード) データソースURL https://plantgarden.jp/
BUSCO バージョン 5.2.2 BUSCO データセット embryophyta_odb10
BUSCO ゲノム C:99.5%[S:1.7%,D:97.8%],F:0.2%,M:0.3%,n:1614 BUSCO 遺伝子 (pep/cds) C:96.5%[S:12.6%,D:83.9%],F:2.2%,M:1.3%,n:1614

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染色体 /
Scaffolds
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fasta
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