配列名:IBA_r1.0
ゲノム配列名 | IBA_r1.0 | 系統名 | Xushu 18 |
配列数 | 109,986 | 染色体数 | 2n = 6x = 90 |
配列長 (bp) | 2,907,375,442 | N50長 (bp) | 23,279,505 |
遺伝子の数 | 175,633 | 遺伝子数由来ファイル | IBA_r1.0.complete.cds.fa |
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 | 175,748 | Hayai-Annotation バージョン | zen_v2.0 |
シーケンシングの方法 | Illumina PE, MP, 10X Genomics, PacBio | 取得した配列量 | 365.8x |
アセンブリ方法 | Denovo MAGIC 3, Linkage map | 推定ゲノムサイズ (Mb) | 2,604 |
シーケンシングの方法のコメント | NA | コメント | NA |
論文クレジット情報 | 準備中 | データ/DB クレジット情報 | 準備中 |
責任著者 | Sachiko Isobe (Kazusa DNA Res Inst) | データソース名 | Plant GARDEN |
論文 (DOIコード) | データソースURL | https://plantgarden.jp/ | |
BUSCO バージョン | 5.2.2 | BUSCO データセット | embryophyta_odb10 |
BUSCO ゲノム | C:99.5%[S:1.7%,D:97.8%],F:0.2%,M:0.3%,n:1614 | BUSCO 遺伝子 (pep/cds) | C:96.5%[S:12.6%,D:83.9%],F:2.2%,M:1.3%,n:1614 |