Solanum tuberosum配列名：SolTub_3.0
| ゲノム配列名 | SolTub_3.0 | 系統名 | DM1-3 516 R44 |
| 配列数 | 13 | 染色体数 | 2n = 2x = 24 |
| 配列長 (bp) | 810,654,046 | N50長 (bp) | 61,165,649 |
| 遺伝子の数 | 56,210 | 遺伝子数由来ファイル | Solanum_tuberosum.SolTub_3.0.pep.all.fa |
| Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 | 56,210 | Hayai-Annotation バージョン | zen_v2.0 |
| シーケンシングの方法 | Illumina | 取得した配列量 | 114x |
| アセンブリ方法 | SOAPdenovo v. 1014 | 推定ゲノムサイズ (Mb) | 856 |
| シーケンシングの方法のコメント | NA | コメント | DM1-3 516 R44 resulted from chromosome doubling of a monoploid(1n=12) derived by anther culture of a heterozygous diploid (2n=24) S. tuberosum group Phureja clone (PI 225669). It is weakly growing, flowering, and hardly produces any tubers. |
| 論文クレジット情報 | 準備中 | データ/DB クレジット情報 | 準備中 |
| 責任著者 | The Potato Genome Sequencing Consortium, Sanwen Huang (Chinese Academy of Agricultural Sciences), C. Robin Buell (Michigan State University), Richard G. F. Visser (Wageningen University) | データソース名 | Ensembl |
| 論文 (DOIコード) | 10.1038/nature10158 | データソースURL | http://plants.ensembl.org/index.html |
| BUSCO バージョン | 5.1.0 | BUSCO データセット | embryophyta_odb10 |
| BUSCO ゲノム | C:99.3%[S:97.6%,D:1.7%],F:0.3%,M:0.4%,n:1614 | BUSCO 遺伝子 (pep/cds) | C:74.6%[S:53.5%,D:21.1%],F:5.6%,M:19.8%,n:1614 |
