配列名:DM_v4.03
ゲノム配列名 | DM_v4.03 | 系統名 | DM1-3 516 R44 |
配列数 | 13 | 染色体数 | 2n = 2x = 24 |
配列長 (bp) | 773,029,432 | N50長 (bp) | 59,756,223 |
遺伝子の数 | 56,215 | 遺伝子数由来ファイル | Stuberosum_448_v4.03.protein.fa |
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 | 56,215 | Hayai-Annotation バージョン | zen_v2.0 |
シーケンシングの方法 | Sanger, Illumina, 454 | 取得した配列量 | NA |
アセンブリ方法 | SOAPdenovo v. 1014, SOAP 2.20, SSAHA2 | 推定ゲノムサイズ (Mb) | 954 |
シーケンシングの方法のコメント | NA | コメント | DM1-3 516 R44 resulted from chromosome doubling of a monoploid(1n=12) derived by anther culture of a heterozygous diploid (2n=24) S. tuberosum group Phureja clone (PI 225669). It is weakly growing, flowering, and hardly produces any tubers. |
論文クレジット情報 | 準備中 | データ/DB クレジット情報 | 準備中 |
責任著者 | Glenn J. Bryan (The James Hutton Institute) | データソース名 | Phytozome |
論文 (DOIコード) | 10.1534/g3.113.007153 | データソースURL | https://phytozome.jgi.doe.gov/pz/portal.html |
BUSCO バージョン | 5.1.0 | BUSCO データセット | embryophyta_odb10 |
BUSCO ゲノム | C:99.3%[S:97.6%,D:1.7%],F:0.3%,M:0.4%,n:1614 | BUSCO 遺伝子 (pep/cds) | C:74.6%[S:53.5%,D:21.1%],F:5.6%,M:19.8%,n:1614 |