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アセンブル , シーケンス , Assemble , Sequence , Solanum melongena , Eggplant , ナス

Solanum melongena

Genome Assembly ID:t4111.G001

配列名:Eggplant_V4.1

ゲノム配列の詳細

ゲノム配列名 Eggplant_V4.1 系統名 24532
配列数 13 染色体数 2n = 2x = 24
配列長 (bp) 1,164,419,523 N50長 (bp) 92,127,910
遺伝子の数 34,916 遺伝子数由来ファイル Eggplant_V4.1_protein.function.fa
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 0 Hayai-Annotation バージョン zen_v2.0
シーケンシングの方法 illumina, Hi-C 取得した配列量 NA
アセンブリ方法 TRITEX pipeline 推定ゲノムサイズ (Mb) 1,210
シーケンシングの方法のコメント NA コメント NA
論文クレジット情報 準備中 データ/DB クレジット情報 準備中
責任著者 Giovanni Giuliano (ENEA, Casaccia Res Ctr) データソース名 Sol Genomics Network
論文 (DOIコード) 10.1111/tpj.15313 データソースURL https://solgenomics.net/
BUSCO バージョン 5.1.0 BUSCO データセット embryophyta_odb10
BUSCO ゲノム C:98.8%[S:97.1%,D:1.7%],F:0.7%,M:0.5%,n:1614 BUSCO 遺伝子 (pep/cds) C:89.1%[S:86.7%,D:2.4%],F:7.0%,M:3.9%,n:1614

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染色体 /
Scaffolds
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fasta
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