配列名:M6_v4.1_PM
ゲノム配列名 | M6_v4.1_PM | 系統名 | M6 |
配列数 | 13 | 染色体数 | 2n = 2x = 24 |
配列長 (bp) | 867,067,562 | N50長 (bp) | 49,944,156 |
遺伝子の数 | 37,740 | 遺伝子数由来ファイル | pasa_m6.hc.gene_models.repr.pep.fa |
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 | 37,740 | Hayai-Annotation バージョン | zen_v2.0 |
シーケンシングの方法 | Illumina HiSeq 2500 | 取得した配列量 | NA |
アセンブリ方法 | ALLPATHS遯カ莨クG (v.51828), GapCloser (v.1.12r6) | 推定ゲノムサイズ (Mb) | 882 |
シーケンシングの方法のコメント | NA | コメント | M6 is a diploid inbred clone of the high遯カ霄ォlycoalkaloid遯カ螢ャroducing tuber遯カ閾」earing potato species Solanum chacoense. |
論文クレジット情報 | 準備中 | データ/DB クレジット情報 | 準備中 |
責任著者 | C. Robin Buell (Michigan State University) | データソース名 | Spud DB Potato Genomics Resource |
論文 (DOIコード) | 10.1111/tpj.13857 | データソースURL | http://potato.plantbiology.msu.edu/ |
BUSCO バージョン | 5.1.0 | BUSCO データセット | embryophyta_odb10 |
BUSCO ゲノム | C:98.8%[S:96.1%,D:2.7%],F:0.6%,M:0.6%,n:1614 | BUSCO 遺伝子 (pep/cds) | C:93.7%[S:90.8%,D:2.9%],F:4.2%,M:2.1%,n:1614 |