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アセンブル , シーケンス , Assemble , Sequence , Nicotiana benthamiana , Benth, Benthi, Tjuntiwari , タバコ野生種 (benthamiana種), ベンサミアナタバコ

Nicotiana benthamiana

Genome Assembly ID:t4100.G005

配列名:NbQld183

ゲノム配列の詳細

ゲノム配列名 NbQld183 系統名 wild accession QLD
配列数 20 染色体数 2n = 4x = 38
配列長 (bp) 2,934,991,643 N50長 (bp) 140,740,346
遺伝子の数 49,602 遺伝子数由来ファイル NbQld183.v103.gff3.CDS.fasta.AA.fasta.gz
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 0 Hayai-Annotation バージョン zen_v2.0
シーケンシングの方法 PacBio Sequel and RSII, Oxford Nanopore, Bionano optical mapping, Hi-C 取得した配列量 NA
アセンブリ方法 CANU v.1.81, DBG2OLC v.20160205, Juicer v.1.6, 3D-DNA branch 201008 推定ゲノムサイズ (Mb) NA
シーケンシングの方法のコメント NA コメント NA
論文クレジット情報 準備中 データ/DB クレジット情報 準備中
責任著者 Peter M. Waterhouse (QUT: Queensland University of Technology) データソース名 Benthamania
論文 (DOIコード) 10.1038/s41477-023-01489-8 データソースURL https://www.nbenth.com
BUSCO バージョン BUSCO データセット
BUSCO ゲノム BUSCO 遺伝子 (pep/cds)

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染色体 /
Scaffolds
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fasta
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