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アセンブル , シーケンス , Assemble , Sequence , Nicotiana benthamiana , Benth, Benthi, Tjuntiwari , タバコ野生種 (benthamiana種), ベンサミアナタバコ

Nicotiana benthamiana

Genome Assembly ID:t4100.G003

配列名:Nbe_v1.1

ゲノム配列の詳細

ゲノム配列名 Nbe_v1.1 系統名 LAB strain
配列数 1,668 染色体数 2n = 4x = 38
配列長 (bp) 2,926,135,461 N50長 (bp) 141,754,421
遺伝子の数 57,583 遺伝子数由来ファイル Nbe_v1_pep_HC.fa.gz
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 0 Hayai-Annotation バージョン zen_v2.0
シーケンシングの方法 PacBio HiFi 取得した配列量 48.1x
アセンブリ方法 Hifiasm 推定ゲノムサイズ (Mb) 3,120
シーケンシングの方法のコメント NA コメント Nbe.v1.1 data for download is temporarily inaccessible. Only Nbe.v1 is available for download.
論文クレジット情報 準備中 データ/DB クレジット情報 準備中
責任著者 Sachiko Isobe (Kazusa DNA Research Institute) データソース名 NbenBase
論文 (DOIコード) 10.1093/pcp/pcac168 データソースURL https://nbenthamiana.jp/
BUSCO バージョン BUSCO データセット
BUSCO ゲノム BUSCO 遺伝子 (pep/cds)

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染色体 /
Scaffolds
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fasta
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