配列名:Nitab4.5
ゲノム配列名 | Nitab4.5 | 系統名 | var. K326; PI552505 |
配列数 | 24 | 染色体数 | 2n = 4x = 48 |
配列長 (bp) | 2,924,271,002 | N50長 (bp) | 116,194,611 |
遺伝子の数 | 69,500 | 遺伝子数由来ファイル | Nitab-v4.5_proteins_Edwards2017.fasta |
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 | 0 | Hayai-Annotation バージョン | zen_v2.0 |
シーケンシングの方法 | Illumina HiSeq 2500 | 取得した配列量 | 17x |
アセンブリ方法 | gsAs- sembler v2.8 | 推定ゲノムサイズ (Mb) | 450 |
シーケンシングの方法のコメント | NA | コメント | NA |
論文クレジット情報 | 準備中 | データ/DB クレジット情報 | 準備中 |
責任著者 | Kieron Edwards (British American Tobacco) | データソース名 | the Solanaceae Genomics Network , NCBI |
論文 (DOIコード) | 10.1186/s12864-017-3791-6 | データソースURL | https://solgenomics.net/organism/Nicotiana_tabacum/genome and ftp: ftp://ftp.sgn.cornell.edu/genomes/Nicotiana_tabacum/ edwards_et_al_2017/ |
BUSCO バージョン | BUSCO データセット | ||
BUSCO ゲノム | BUSCO 遺伝子 (pep/cds) |