配列名:CKIhap1_r1.0
ゲノム配列名 | CKIhap1_r1.0 | 系統名 | NIAS Genebank 171490 |
配列数 | 9 | 染色体数 | 2n = 2x = 18 |
配列長 (bp) | 304,161,186 | N50長 (bp) | 33,465,452 |
遺伝子の数 | 0 | 遺伝子数由来ファイル | NA |
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 | 0 | Hayai-Annotation バージョン | zen_v2.0 |
シーケンシングの方法 | PacBio Hifi, Omni-C | 取得した配列量 | 26.6X |
アセンブリ方法 | Hifiasm | 推定ゲノムサイズ (Mb) | 356 |
シーケンシングの方法のコメント | NA | コメント | Phased genome, hap1 |
論文クレジット情報 | 準備中 | データ/DB クレジット情報 | 準備中 |
責任著者 | Sachiko Isobe (Kazusa DNA Res Inst) | データソース名 | Plant GARDEN |
論文 (DOIコード) | 10.1101/2023.06.02.543356 | データソースURL | https://plantgarden.jp/ |
BUSCO バージョン | 3.0.2 | BUSCO データセット | embryophyta_odb10 |
BUSCO ゲノム | C:97.7%[S:96.4%,D:1.3%],F:0.6%,M:1.7%,n:1375 | BUSCO 遺伝子 (pep/cds) | NA |