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アセンブル , シーケンス , Assemble , Sequence , Citrus kinokuni , Kishu mikan , キシュウミカン

Citrus kinokuni

Genome Assembly ID:t408488.G001

配列名:CKIuph_r1.0

ゲノム配列の詳細

ゲノム配列名 CKIuph_r1.0 系統名 NIAS Genebank 171490
配列数 9 染色体数 2n = 2x = 18
配列長 (bp) 314,306,740 N50長 (bp) 33,834,364
遺伝子の数 0 遺伝子数由来ファイル NA
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 0 Hayai-Annotation バージョン zen_v2.0
シーケンシングの方法 PacBio Hifi, Omni-C 取得した配列量 26.6X
アセンブリ方法 Hifiasm 推定ゲノムサイズ (Mb) 356
シーケンシングの方法のコメント NA コメント Unphased genome
論文クレジット情報 準備中 データ/DB クレジット情報 準備中
責任著者 Sachiko Isobe (Kazusa DNA Res Inst) データソース名 Plant GARDEN
論文 (DOIコード) 10.1101/2023.06.02.543356 データソースURL https://plantgarden.jp/
BUSCO バージョン 3.0.2 BUSCO データセット embryophyta_odb10
BUSCO ゲノム C:98.3%[S:97.1%,D:1.2%],F:0.3%,M:1.4%,n:1375 BUSCO 遺伝子 (pep/cds) NA

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染色体 /
Scaffolds
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fasta
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